с точки зрения физико-химических законов и параметров фрагмент ДНК, кодирующий некий вполне функциональный белок (фермент, рецептор, мембранный транспортер и т. д.), ничем не отличатся от бессмысленной последовательности той же длины (у которой, скажем, на втором или третьем месте стоит стоп-кодон). Вообще из физических законов никак не следует, что генетический код может быть только таким, каков он есть, и в частности - что именно кодоны UAA, UAG и UGA не могут быть ничем кроме стоп-кодонов.
1) "с точки зрения законов"
2) "Вообще из физических законов никак не следует"
Как раз это все следует из физических законов и более не из чего.
Просто здесь "физикой" назначен набор "законов" и методов, которые заведомо не позволят вычислить функцию кодона в данном молекулярном комплексе. А если ничтоже сумняшеся физик затеет такое вычисление, будет немедленно "компетентными товарищами" наставлен на путь истинный - низззя.
Вообще и эта цитата, и тред из которого она взята, и предыстория - это все нескончаемая борьба "компетентных" с "редукционизмом". Биологи все еще увлекаются борьбой вейсманизма с морганизмом ;-), хотят назначать свои законы. Ну или хотя бы вещать от имени высших сил (Провидение, Создатель и т.п.) Приятно же. Ну и нос физикам прищемить - типа выше в иерархии.
Между тем буквально на наших глазах эти борцы весьма характерно обделались и втихаря пользуются той самой физикой. А что делать ?! Попытки сформулировать какие-то "законы" формирования белковых молекул провалились.
Вот рибосома транслирует последовательность кодонов в последовательность аминокислот. И нуклеиновая и полипептидная цепи являются линейными молекулами. Вдруг .... трах-тарарах ! - фолдинг. Полипептидная цепь сворачивается в какую-то замысловатую фиговину форма которой очевидно обусловлена (то есть записана в) последовательностью аминокислот, следовательно - и кодонов, но прочитать ее биология "не шмогла". Пришлось считать эту форму по законам физики. А там, на минуточку, тысячи не очень сферических частиц.
Требуются огромные вычислительные ресурсы. Университеты заводят суперкомпьютеры, фармацевты тож, государство жертвует машинное время... А еще буквально по миру пошли:
BOINC представляет собой распределённую сеть из более чем 830 000 активных компьютеров (хостов) со средней производительностью всей сети более 20 петафлопс[1]. Пиковая мощность проекта BOINC зафиксирована на уровне 320 петафлопс, что более чем в три раза превосходит пиковую мощность самого мощного суперкомпьютера на Земле.
...
Rosetta@home — вычисление 3-мерной структуры белков из их аминокислотных последовательностей.
в том числе. вполне может статься, что пока очередной биолог с экрана твоего компьютера рассказывает про ужасы редукционизма, в твоем компе BOINC-клиент и считает молекулу для диссертации этого борца. Это ж то самое: насрать перед дверью, позвонить и попросить бумажку.
Работа рибосомы не сильно сложнее, чем фолдинг белка, просто этим никто не занимается - если известно, что UAA - стоп-кодон, на фига еще тратить петафлопы. Лучше заняться борьбой с ними.
Этот пост изначально помещен в http://vlkamov.dreamwidth.org